四川大学华西第二医院源于1896年成立的仁济女医院，开设妇产科和儿科。1987年原卫生部批准华西妇产科和儿科从原华西医科大学附属医院迁出单独建院，成立华西医科大学附属第二医院，又名华西妇产儿童医院。2000年医院更名为“四川大学华西第二医院/华西妇产儿童医院”，是国家卫生健康委员会委预算管理医院和全国首批“三级甲等”妇女儿童专科医院，是国家儿童区域医疗中心(西南)，是集医疗、教学、科研、预防保健和人才培养为一体的大学附属医院。1993年被国家卫生计生委、联合国儿童基金会和世界卫生组织授予“爱婴医院”称号，1998年被评为国家“三级甲等妇产儿童专科医院”，2003年被全国总工会授予“全国女职工先进集体”称号，2008年被全国总工会授予“抗震救灾，重建家园工人先锋号”旗帜，2009年被全国总工会授予“全国五一劳动奖状”，2012年获“全国三八红旗集体”称号，2015年获“全国五一巾帼标兵岗”称号，2018年获“进一步改善医疗服务行动计划全国擂台赛”西南赛区“创新推进‘互联网+医疗健康’”第二名并入选十大价值案例，获2018年度全国改善医疗服务最具示范案例、2020年度全国“改善医疗服务示范医院”。医院2018、2019连续两年度在全国三级公立医院绩效考核中位列妇产医院（含妇幼保健院）专科系列第一名。
医院现核准床位1580张，其中华西院区730张，锦江院区850张，有24个临床科室和7个医技科室。妇产科学和儿科学均为国家重点学科，妇科、产科、儿科新生儿专业、超声科为国家临床重点专科建设项目，医院为国家更年期保健、新生儿保健、孕产期保健特色专科建设单位。
2021年,四川大学华西第二医院位列复旦大学医院管理研究所《中国医院及专科声誉排行榜》第78位。
